光启元年，尚书右仆射裴璩修复好长安的宫殿后，请求僖宗返回长安。三月，僖宗下令摆驾回长安，结束了近四年的西逃流亡生活。回到京师长安，经历了战争和洗劫的长安已经完全荒废：“荆棘满城，狐兔纵横。”僖宗不禁为眼前凄凉的情景叹息，于是下令把长安附近的百姓迁入长安城居住，同时免除长安城商人的赋税一年。
三月，幽州李可举、镇州王景崇连兵寇定州，节度使王处存求援于李克用；李克用遣大将康君立、安老、薛可、郭啜率兵赴之。五月，镇人攻无极，李克用亲领兵救之。镇人退保新城，李克用攻之，斩首万余级，获马千匹。王处存亦败燕军于易州。
僖宗在长安的宝座还没有坐热，大宦官田令孜怒王重荣据盐池富饶之地。对僖宗说：“巨盗甫定，国用捉襟见肘，诸军无所仰依，不如让老奴的神策军使，建请河中二池领属盐铁，佐军食。”僖宗许之。王重荣不许，奏言：“以往岁输盐三千乘于有司，则斥所余以赡军，所剩不多。”僖宗遣使者谕旨，王重荣不听。田令孜教唆僖宗徙重荣为兖海节度使，以王处存代之。王重荣上书劾田令孜说：“阉人田令孜，贪心不足，离间方镇，掌控皇帝，把持朝政，本太尉为国家奋不顾身，驱逐贼寇黄巢出长安，与贼寇在关中数百战，立功无数，没想到现在却被田令孜谗害，天下有正义之心、良心的人都应该联合起来清君侧，以正朝纲”。田令孜看到王重荣的弹劾书，大怒，遣神策军与邠宁节度使朱玫、凤翔节度使李昌符和检校司徒、同中书门下平章事王处存等军进讨王重荣。
田令孜调王处存任河中节度使，王处存上奏说：“王重荣立有大功劳，不能调动，使众藩镇担心。”僖宗不采纳，催王处存上路。王处存带领军队到达晋州，晋州刺史冀君武关闭城门不接纳，王处存只好带兵返回。
朱玫和李昌符壁沙苑，王重荣与朱玫、李昌符等大战，累月不胜，乃使反间计，令人写一份假的僖宗诏书诒李克用，说：“奉密诏，须公到，使我图公。此田令孜、李昌符、朱全忠和朱玫之惑上也。”因示伪诏与李克用。李克用与朱全忠有隙，信之，上书朝廷说：“田令孜欺君罔上，陷害忠良，朱温、李昌符和朱玫为虎作伥，请讨田令孜、朱全忠、李昌符及朱玫”。僖宗看到李克用的奏章，大惊。数诏和解说：“陇西王不要听信谗言，其实这都是王重荣的阴谋诡计。”李克用不听。
光启二年，李克用率领精兵五万从太原出发，来到河中，王重荣杀猪宰羊款待李克用。王重荣对李克用说：“收复长安、大败黄巢，大王与我功最高，没想到田令孜和朱温既然想谋害我们。”李克用怒说：“田令孜只是一个阉人，朱玫和李昌符只是匹夫之勇，朱温是阴险小人，我们都应该联合清除。”王重荣大喜，请求与李克用结为亲家，李克用答应，把女儿嫁给王重荣的儿子王珂，两人亲上加亲，再次开怀畅饮。
明日，两人合兵来到沙苑，王重荣在左，李克用在右，等待朱玫和李昌符等军到来。李昌符听闻李克用到来，大惊说：“李克用勇冠三军，是不好惹的！不如我们与他议和吧？”朱玫大怒说：“李克用那个沙陀奴对付黄巢那些乌合之众当然勇冠三军，对付我们他就差远了，想我当年在郑从谠手下将其屡败，把他赶到鞑靼那里变成了丧家之犬，他大败黄巢只不过是他的运气好。”李昌符于是和朱玫领军出战。
两军对峙，李克用和王重荣跃马而出，朱玫和李昌符也出列，朱玫对李克用说：“王重荣违抗皇命，皇上有令，王重荣造反，令我们前来讨伐，无关人等不得干涉。”李克用大笑说：“击败黄巢，本王与王重荣居功至伟，将军与宦官田令孜却陷害大将，本王是看不过去，一定要管！”朱玫大怒，领军与李克用、王重荣厮杀，朱玫与李克用大战七十回合，不敌，李昌符也敌不过王重荣，两人落慌而逃，李克用与王重荣一阵横击，朱玫、李昌符等军大败，朱玫奔邠州，李昌符奔回凤翔。神策军溃还京师，遂大掠。
李克用乘胜西进，田令孜夹持僖宗走凤翔，襄王李煴也跟着出逃。朱玫听闻京师大乱，立即领兵入京师。李煴突然肚子痛，于是开始上茅坑，因为蹲得太久了，出来的时候被邠宁节度使朱玫抓住，李煴连忙求朱玫饶命，朱玫见李煴懦弱，‘一不做二不休’，拥立襄王李煴为帝，李煴不敢反抗，改元建贞，建置百官，令朱玫执掌军政大权。
僖宗四处辗转，最后由当时的神策军将领宋文通、韩建和王建等护卫着逃往凤翔，刚来到半路，凤翔节度使李昌符的将士就告知僖宗要来，李昌符对众将领说：“朱玫大败于李克用，立即率兵造反，拥立新帝，不如本节度使也劫持僖宗。”于是准备领兵拦截，刚到龙尾坡，李昌符突然领兵杀出，大叫：“阉人田令孜，快快把皇上释放。”田令孜大惊，说：“好你个李昌符，皇上对你不薄，你既然敢造反！”李昌符大叫说：“我这是叫勤王，不叫造反，你才是造反。”田令孜大怒，令神策军指挥使宋文通率王建、韩建等抵挡李昌符。宋文通带兵猛攻，王建和韩建飞马而上，砍数将下马，李昌符抵挡不住，全部被歼，李昌符一个人逃回凤翔城。僖宗和田令孜见宋文通因为立了首功，封宋文通为凤翔节度使节度使，王建、韩建为金吾将军，并赐宋文通名李茂贞，僖宗还亲自为他定字为正臣。
田令孜见李昌符都谋反，于是下令摆驾宝鸡，僖宗见田令孜搞得关中大乱还引狼入室，搞得自己狼狈不堪，乃起用杨复恭为枢密使，以分田令孜之权。
李克用打败朱玫、李昌符后回到河中，与王重荣又一次上表请求唐僖宗回宫，并指陈田令玫的罪状说：“阉人田令玫，离间群臣关系，煽动大将谋反，欺君罔上，请皇上将其诛杀”。田令孜看到李克用与王重荣的奏章，心理非常害怕，想继续控制唐僖宗，作为保护自己的屏障，因此对僖宗说：“大臣们已经不可信任，我们还是逃往兴元比较安全。”唐僖宗不听从，拒绝到兴元。夜里，田令孜率兵冲人行宫，劫持唐僖宗逃往宝鸡。朱玫、李昌符见田令孜大势已去，又害怕李克用、王重荣，因此改附李克用。
朱玫令大将王行瑜带兵五万追击外逃的唐僖宗。僖宗以正统为号召，令王重荣和李克用等反攻朱玫。王行瑜兵临城下，下令攻城。李茂贞率军拼命抵挡，杀伤敌人甚多。击退敌人的进攻后，僖宗站上城楼对叛军说：“汝等皆是朕之将士，为何跟随逆贼造反？”王行瑜说：“臣等家属皆在长安被朱玫夹持，也是逼不得已！”僖宗对王行瑜说：“将军如能率众还长安诸杀朱玫，朕封将军为邠宁节度使”。王行瑜大喜，立即下跪，将士跟着下跪，僖宗当众宣布封王行瑜为邠宁节度使，王行瑜对众将士说：“朱玫深受朝廷厚恩却不思报答，还拥立襄王李煴造反，我们杀回长安。”于是反戈。
光启二年十二月，王行瑜带兵偷偷返回长安，守门将士问：“何人？”王行瑜说：“是我，我们已经凯旋，快开城门。”守门将领看到是王将军，连忙下令打开城门。王行瑜等城门一开，立即挥剑一阵大杀，长安的叛军个个逃命，朱玫正在和几个宫女喝酒行乐，将士匆匆忙忙冲进禀报说：“王行瑜造反，带兵杀回长安，现在已经到午门。”朱玫大惊，手中的酒杯立即掉地上。于是立即下令：“召集军队。”亲将召集了数百人，朱玫带领他们冲出，两边对垒，王行瑜以剑指朱玫说：“皇上有令，诛杀叛贼朱玫。”朱玫大怒说：“我对你不薄，没想到你既然加兵于是我。”王行瑜说：“识时务者为俊杰，大家都是为了权力，你不要怪我！”双方于是大战，六十回合后王行瑜将朱玫一刀砍于马下，其党羽数百人被斩杀，王行瑜哈哈大笑，又纵兵大掠，长安再次成为地狱。
一些官员奉李煴逃奔出城，李煴害怕不已，对心腹说：“我们路在何方？”心腹说：“河中王重荣忠义，我们前去投奔他，相信他会接纳。”李煴于是下令摆驾河中。
僖宗听闻王行瑜斩杀了朱玫，大喜。封王行瑜为邠宁节度使，加封李茂贞为凤翔和陇右节度使。大部分朝官憎恨田令孜，不愿去宝鸡，要夺唐僖宗回城。李克用令朱玫、李昌符率兵进攻宝鸡，田令孜又带着唐僖宗逃往汉中。李克用传檄到汉中说：“田令孜挑拨藩镇，夹持皇帝，请节度使杨守亮将其诛杀。”杨守亮与其叔叔杨复恭商议，杨复恭怒说：“大唐天下我们杨家安定下来的，明公杨复光去世后，田令孜这个小人既然夺取我们杨家的大权，我已经忍了他很久了。”杨守亮怒说：“我已经准备好军队，田令孜不交出大权，我让他死无葬身之地。”田令孜失势穷困，知道自己已不为天下所容，只好让位给宦官杨复恭，自任为西川监军使，到成都投靠其大哥陈敬瑄。
唐僖宗重新起用畅复恭为枢密使，代田令孜为观军容使。王建等素为令孜所厚，杨复恭惧建不附己，乃出建等五将为郡守，以王建为壁州刺史，以韩建为潼关防御使兼华州刺史。王处存为易定节度使。田令孜的党羽全部被杨复恭斥逐。
李煴来到河中，王重荣假装迎奉，李煴哭说：“天下藩镇，只有公对朕是忠心。”王重荣冷笑，一声令下，伏兵尽出，李煴大惊，说：“太傅意欲何为？”王重荣怒说：“叛贼李煴造反称帝，将李煴等抓住。”李煴连忙向王重荣下跪说：“我是受到朱玫摆布，现在已经取消了帝号，请太傅饶我一命。”王重荣一刀将其砍了，把他的首级函送僖宗的行在兴元。重荣性悍酷，多杀戮，少纵舍。尝植大木河上，内设机轴，有忤意者，辄置其上，机发皆溺。尝辱部将常行儒，行儒怨之。
光启三年，常行儒引兵夜攻河中府，重荣亡出外，常行儒领兵追赶将其抓住，诘旦杀之。重荣兄汾州刺史兼护国军节度使王重盈听闻常行儒造反，大怒，率领大军回讨伐常行儒，王重荣的旧将纷纷迎接王重盈。常行儒大惧，想逃跑，被将士抓住交给王重盈，王重盈将其处死。
王行瑜重新夺回了长安，请求僖宗摆驾回宫。唐僖宗于光启四年正月回到长安，因长途劳累奔波、惊吓，突然重病，僖宗病危之时，宰相孔纬和几个大臣商议说：“僖宗子幼，拟立皇弟吉王李保为嗣君。”众大臣然之。枢密使杨复恭大怒说：“寿王杰聪明又有才华，乃真正的人君！请立皇弟寿王李杰”。寿王与僖宗同母所生，僖宗一再出奔，寿王都随从左右，僖宗也特别倚重他。于是众大臣不敢反对，由杨复恭倡议，奏请僖宗，此时僖宗已经不能说话，只是略微点头算是恩准了，于是文德元年三月下诏立寿王李杰为皇太弟，监军国事。当天杨复恭就令中尉刘季述，率禁兵迎入寿王，安置在少阳院，由宰相孔纬，杜让能带人去观察。群臣见寿王“体貌明粹，饶有英气，亦皆私庆得人”。
明日，僖宗驾崩，遗诏命太弟杰嗣位，改名为敏，寿王即位柩前，又改名为晔，是谓昭宗。开心皇帝唐僖宗只活到二十七岁就死了，在位十五年。昭宗加杨复恭开府、金吾上将军，专领禁兵。