吴用上山做了军师，索超在皲州一无所获，刚探听到一点线索，却被谢都管带人抓回去治罪，此事被宋江得知，提前通知索超，索不愿逃走，争斗中误杀谢，亡命天涯，此时梁山收沉晁的消息传来，蔡京怒，命官兵备战命，二战梁山。
梁山准备攻打祝家庄，瓦解三庄联盟，李应推脱保持中立，扈家庄选择相助。
一打祝家庄，杀祝氏三杰。俘虏扈家兄妹。晁盖私自瞒着李景给宋江送了金银，宋江失手杀人，逃脱了制裁，一路去往柴进庄上;路上吸引了不少好汉。
同时，梁山挫败了官兵的第二次进攻，降服张清等将领，蔡京与高俅开始重视梁山，组织起了第三次围剿，这回还带上了水军。
梁山护送的商队在徐州被芒汤山山贼劫持，进攻后，梁山将控制范围扩展至了徐州，与江南建康遥遥相望，初步接触方腊。
呼延灼与水火将军开始对梁山的第三次围剿，宋江突然跑来相助，提供破坏楼船的资料，在关键时刻投靠官军，晁盖战死，梁山与官军两败俱伤。
李景用计战胜了呼延灼，汤隆也赚来了徐宁，李景的情报机构初显威力。
蔡京改用招抚策略，但被拒，只能立出宋江在江湖上同梁山对抗。童贯此时带领西北军打赢西夏，朝廷调西北军精锐第四次围剿。
梁山势力覆盖了京东东路和冀州地区，南至建康，北至燕云，众志成城之下，打败了童贯，主角与方腊、王庆、田虎一同称王。
梁山终于得到了部分读书人的效忠。宋腹背受敌，为灭梁山，不惜从辽国借兵，辽国自顾不暇，遂于金国合谋，助金灭辽。
方腊与李景交恶，两方交战期间，宋与金突然向梁山进攻，还好李景有所防备，损失不大。
通过说客与方腊然和之后，梁山以防御金国进攻宋国为主，两国各怀心思，金国正在消化辽国，并不救援宋国。
梁山势力进入中原，方腊开始向南洋扩充势力。李景与王庆、田虎相约进攻金国，田虎拒绝，两方与金相持一年，勉强打退金国。
金国退后，梁山正式灭宋，并攻灭田虎，王庆见状投降，主角正式称帝。
国号为梁。天下三分，李景决定暂与方腊交好，攻打金国，但方腊担心梁山对其下手，决心先下手，联系金国灭梁。
梁山兵分两路，以林冲为首防备金国，以李景为首攻打江南，历时两年，终一统。
五年后准备好的梁国起兵灭金，占据了草原，同时将元朝扼杀在了摇篮里。
通过教化、移民等手段，将草原牢牢握在了中原王朝的手中。