就在倭寇准备登陆宝山所的时候，戚继光也在紧张的准备着。戚继光没有多说什么，只是让明军水手们去收殓死难同胞的遗体。几乎所有的明军水手都是红着眼睛回来的。
戚继光站在已经是一片残垣断壁的崇明县城上，戚继光指着江南的松江府，冲天的烽烟已经燃起，戚继光大声说道：“倭寇，就在江南。”
所有的水手们都愤怒了，他们都是浙直两省的人，江南就是他们的故乡，见过了倭寇的残暴之后，他们对于倭寇只有冲天的怒火，纷纷高声喊道：“杀贼！杀贼！”
戚继光让亲兵们制止了水手们的喊叫，说道：“水师马上开拔，堵截倭寇，有炮的在前，无炮的在后，所有水手都要准备白刃战，炮不到百步不放，小船载满火油等引火之物，直冲倭船，打乱倭船阵型。”
戚继光最后高声喊道：“此战，有我无贼！”在亲兵们的带领下，有我无贼的喊声震动天地，明军开始登船备战。
戚继光的想法很简单，先用火船打乱倭寇的阵型，然后利用官军船大炮多的优势抵近射击，然后撞击倭船，利用福船高大坚固的优势对抗倭寇。
现在地形和水文都有利于明军，若是在大海上遭遇倭寇，倭寇可以利用自己灵活轻便的优势扬长而去，可是现在是在长江口，虽然江口也非常宽阔，但是毕竟是江，两岸就已经把倭船给限制死了，若是倭寇直接离去，戚继光当然不会追击倭寇，但是现在倭寇竟然敢再次袭击松江，天予不取，反受其咎。
明军水师开拔的消息很快就传到了徐海这里，不过他并不太惊慌，陆上他承认他的手下弄不过倭寇，但是在水上，他自认他还是有两把刷子了，至少可以脱身的。
徐海从容指挥倭寇的船队，准备撤离此地，至于辛五郎，不好意思，死道友不死贫道了，他也不管倭寇的船只走不走，自己先带着自己的手下准备离开了。
没想到戚继光来的极快，明军的快船满载火油等引火之物，从江心直奔徐海的船队，这会的船只都是木质的，一旦遇火，那就悲剧了，徐海赶紧让自己的船队散开，躲避这些火船。
正当徐海躲避火船的时候，官军的福船已经过来了，徐海一看就知道今日有麻烦了，当即抛弃自己的船队，顺流而下，想夺路而逃，只要到了海上，他徐海就能够摆脱明军的追击，到时候大不了东山再起，也未可知嘛。
徐海很果断，要是在一般的明军将领手底下，他今日没准真的逃出生天，卷土重来了，但是很可惜，他今日遇到的是戚继光。
戚继光将福船编在一起，正面当敌，而行动迅速的苍山船等，则在福船两翼，发现有想要逃窜的倭船，苍山船就会利用自己的速度优势冲上去拖住他。
海盗和倭寇们见徐海率先逃跑，也就根本不管什么了，纷纷夺陆而逃。但是又被明军的苍山船拖住，船上的明军利用火箭能武器，破坏倭船的船帆，迟缓他们的行动，给福船争取时间。
倭寇们见明军紧追不舍，也被激出了凶性，干脆与明军混战在一起，双方的水手用火炮，火铳还有弓弩互相射击，同时也都在准备跳帮作战。
徐海这下也不跑了，重新开始指挥抵抗，徐海觉得，要是跳帮白刃战，那自己手下还是比明军强多了，现在江面狭窄，眼看就成了一场混战，由于怕误伤自己人，双方的火炮恐怕都不能打几轮，就得跳帮作战，明军向来软弱，白刃战绝不是自己手下这些海盗和倭寇的对手。
徐海也注意到了戚继光的坐船，明军的主帅就在船上，徐海觉得，要是是干掉明军主帅，明军肯定会士气崩溃，徐海连忙打出旗语，指挥着附近的几只船直扑戚继光的坐船。
戚继光看着直奔自己来的倭寇，大笑一声说道：“来的好！”戚继光的大福船是明军水师中最大最坚固的船只，戚继光的三百多亲兵都在船上，戚继光在亲兵的帮助下披甲，取过自己家传的宝刀，他的坐船乘风破浪，直冲倭寇而去。
一条倭寇的小船直接被戚继光的坐船撞沉，不过戚继光的坐船也因此慢了下来，徐海抓住机会，数条倭船一起上前，准备跳帮。首先迎接他们的就是佛郎机的怒吼，虽然佛郎机的射程近，威力也不大，但是胜在射速快。
戚继光下令不必节省弹药，明军的炮手一股脑将所有的子铳全部打光，拿起火铳到甲板上去迎战倭寇。同时戚继光的亲兵们将一个个方匣子取出来，对准倭船的方向，随着倭船的距离越来越近，明军士卒们都看到到倭船上那些面目狰狞的倭寇和海盗。
戚继光在心中默默计算着距离，差不多到三十仗时，下令明军点燃这些匣子，匣子里装的是明军的独门火器，神火飞鸦，其以竹篾外糊纸做成飞鸦状，腹内装满火药，身下所藏的催火筒实为四枝火箭，斜钉到两翅下，每翅下两枝。然后在鸦身上钻孔，放入药线四条，药线要分开钉连，由总线连起。再将催火筒与鸦腹内炸药药线相连。
施放之后，先以火箭将飞鸦送到目的地，命中目标后，药线引燃鸦腹炸药，顿时火光遍野。虽然说起来神乎其神，但是命中率着实感人，戚继光施放了数十枚神火飞鸦，但是无一命中的，只是倭船为了这些神火飞鸦，不得不临时改变航向。
不过这就足够了，与倭船相距不过十五丈时，戚继光命令点燃这些大匣子，匣子中是明军的百虎齐奔箭，其实就是火箭的一种，但是一匣装有一百支火箭，一次施放，火力密度确实可观，不管是倭寇还是海盗，都没有着甲的习惯，他们又聚集在甲板上等待跳帮，这下成了百虎齐奔箭最好的目标，不少倭寇躲避不及，被射中数箭。