通过这段时间的对锦衣卫的观察，朱载坖发现锦衣卫善于刑讯，但是侦查更多的是凭借经验，并没有一定之规。有些时候就不可避免的存在着侦查盲区。
朱载坖将朱希孝和陆绎叫来，和他们一道复盘本案，要侦查一个案子，最重要的就是确定侦查方向，如果侦查方向错误了，那就等于走进了死胡同。
而确定侦查方向的第一步就是刻画犯罪嫌疑人，这是一切的开始。
朱载坖问道：“你们认为策划本案的首犯是个什么样的人？”
两位锦衣卫头目有些发愣了，他们还从未认真想过这个策划者是个什么样的人。
朱载坖便开始分析起来了，这位一定是个胆大妄为而又心思缜密的人，胆大妄为，是他敢于袭击大明的皇子亲王，心思缜密则是策划这一次巧妙的袭击，不无显示出此人冷静沉着。
除了分析嫌疑人的性格之外，从作案动机的角度刻画嫌疑人往往是最直观的。而他目的往往直接反映了他的动机，朱载坖问道：“你们认为，此贼做此事的目的何在？”
两位锦衣卫都认为，做此事的目的不在于真的刺杀朱载坖，以刺杀来看的，此事就颇为拙劣了，刺杀要的是精准而迅速，人越多越不利于成功，况且此时朱载坖处于大军的保护之中，要想公开刺杀，比登天还难。
而这次行动的目的，更近似于恐吓，那么他的目的在于逼走朱载坖。
朱载坖问道：“此贼处心积虑，甚至不惜犯下这等大案，仅仅是为了逼孤走，说明什么？”
陆绎说道：“说明殿下不走的话，恐怕他们就要出事。”
朱载坖在内心给陆绎点了赞，孺子可教也！
朱载坖说道：“然也！说明孤不走，就会收拾他们，而且对他们来说，恐怕是难以承受的。”
朱载坖然后和陆绎、朱希孝继续分析起来，首先派出倭寇，原因很简单，倭寇没有动机做此事，很明显是被人利用了。
那么东南士绅呢？从动机上来说，似乎有那么一点可能，但是朱载坖否决了这种可能，或者说这种可能性极低。为什么这么说呢？
首先，朱载坖征收欠粮等事已经做完了，即便是杀了朱载坖，除了招致朝廷的报复之外，不会有任何改变。士绅们是最会权衡利弊的，不会做这等不智之事。
第二点，士绅们可不是一家一口，往往是一个大家族，他们真的会拿自己九族，来冒这个风险吗？显然不太现实，真的要暗杀，直接截杀肯定是最愚蠢的方式，士绅们饱读诗书，精通历史，谁愿意当成济呢？
否定士绅们之后，那答案也就呼之欲出了，陆绎说道：“殿下莫不是怀疑佛门吗？”
朱载坖说道：“并非是怀疑，而是事实如此。”
其实仔细推理的话，朱载坖的怀疑确实有合理之处。
这帮秃驴，不少无父无母，哪有那么多牵挂。是真的敢做这种事情。而且从他们做的事情来看，就是想逼走朱载坖，为什么？因为朱载坖走了，他们的利益就可以保全了，所以他们敢这么做。
而且寺院和倭寇，还真是有私下的交往。在浙江普陀山一带，僧人私创寺院，收揽民众，在倭患严重时作为贼寇侵略本地的助手。嘉靖三十年间寺院曾被倭寇占据，作为巢穴。平定此次倭患后，朝廷出于考虑海防需要，毁寺清僧，并令不许再创建。但僧人不顾禁令，沿复私创宝陀、海潮二寺，远招香客，广致斋粮，根本不把朝廷的进来当回事。
朝廷多次颁布禁约，一是验勘有僧籍之人，登记自册，暂不驱逐，其余私度之人遣散归家；二是不许再私扩寺院，广招徒众；三是不许进香游僧到寺停留常住，违者严惩。然而一切都是徒劳，僧人暗地召唤民众为其偷送物料，企图复建，奸僧恶党，煽惑男妇，复运料物过海，希图再创。
僧人只图发展佛教，全然不顾地区百姓民众生命财产安全，煽惑民众创寺，勾结倭寇，破坏社会安定。这都是有先例可循的，为了创建寺院，他们不惜背叛国家，而现在朱载坖想限制他们，甚至剥夺他们的财产，他们作出此事，不是很正常的事情吗？
而且这些秃驴和倭国秃驴还真是联系紧密，尤其是倭国的秃驴。倭国的秃驴，不但能够直接参与政治，能掌握武装，拥有军队。
而且不少秃驴还专门从事为幕府起草政治、外交文书，参与外务、内务等政治活动。除第一次送交明朝的国书由儒臣东坊成秀起草之外，其余均出自五山禅僧之手。
尤其是倭僧策彦周良，嘉靖十八年、嘉靖二十六年两次出使大明，都长期在杭州居住，与大明的秃驴们互相场合，讲求佛法。而这位策彦周良，可不是一般的秃驴。
嘉靖十八年任遣明副使。嘉靖二十六年任遣明正使。两度入明，受礼遇甚隆，与文人广泛交游。晚年受织田信长厚遇。在倭寇颇有影响力。
凭借佛门与倭国的关系，借来些武士，根本不费事，所以现在虽然还没有什么证据，但是朱载坖对于佛门已经是十分怀疑了。
朱希孝说道：“殿下的分析确有道理，不若直接动手，抄几个寺院，拿了秃驴拷问再说。”
朱载坖摇摇头说道：“不急和他们耍耍！”
眼下朱载坖手里还没有特别过硬的证据，冒然动手反而会遭到反噬，只要朱载坖拿到一点蛛丝马迹，就足够对他们动手了。
所以朱载坖安排陆绎和朱希孝，从人员、船只、行踪等各个方面寻找线索，同时他让朱希孝再次对这些倭寇的尸体加以勘验，看看有没有什么线索，尤其是这些倭寇的随身物品，要仔细勘验，看看有没有什么线索。
朱载坖提醒道：“他们的随身物品上，可能会有他们经过地方的蛛丝马迹，切不可遗漏了。”
朱希孝于是亲自去勘验尸体。