在这些复明军将士的期盼中，众人刚敢集结好队伍，朱由栋也带着周昌等人来到满城外。这时候的满城，就是以前的大明皇宫，看着眼前的巍峨宫殿。众人不由的感慨万千，大明皇宫沉沦十五年后，大明终于又回来了。
正在众人感叹的时候，已经投降的苏松巡按马腾升忙道：“殿下，这里虽然被鞑子据为满城，但是其本质乃是我大明的皇宫。如果真的就此屠城，是不是有上皇家运势。等到殿下在进入皇城居住，爬会感到杀戮太重了。”
朱由栋毫不在意道：“没事，满洲人在皇城里犯下了罪孽，当然要用他们的鲜血来清洗。我大明的皇宫，岂是他们这些野人，鞑子能随意居住的。”朱由栋想了一下，考虑到城里的宫殿。如果毫无顾忌的让军队进去屠城，怕到时候，真的就成了一片废墟了。
想到这些，朱由栋当即，对准备攻打满城的王兴等三人道：“进城以后，不管城里的人是满是汉，一律全部诛杀。城里的金银财物，归攻城的将士所有。但有一点，除了战事必要破坏的，任何人不得损毁城里的建筑。”
王兴等人立即答应道：“殿下放心，我们一定保护好城里的宫殿，不让将士们损毁。”朱由栋挥手道：“我到不是舍不得那些破房子，只是如果真的破坏了，到时候再修这些宫殿，不知道又要耗费多少民力。如果能保存下来，当然是最好的。好了，攻城吧，尽快结束皇城里的战事。”说完朱由栋便直接离开了。
而马腾升则跟在朱由栋后面，道：“殿下真是爱民如子啊，如今才刚刚光复南京，如此爱惜百姓。真是百姓的天大的福分，大明万幸，天下百姓万幸啊。殿下果然是从古至今，天下无双的圣主。”听见马腾升的话，朱由栋不由的又放快了脚步，真怕自己就迷失在马腾升的马屁里了。
等朱由栋回到应天府，对蒋超和马惟兴道：“现在你们的军队也休息一天了，蒋超，你下午就带领军队南下，去接应苟兴旺。击退清军援兵后，乘势攻取广德和宁国二府。马惟兴，你带领军队往东，如果夏国相和杨明遇没有攻下镇江，你就出兵一起攻打镇江。”
两人忙拱手答应，然后马惟兴问道：“殿下，如果夏国相和杨明遇二位将军，已经攻下了镇江，末将该去何处呢？”朱由栋想了一下道：“那你就与水师一起，攻打扬州。不一定要攻下扬州，但一定要消灭清廷在瓜洲的操江水师。”
朱由栋又对林壮道：“你派人跟马惟兴一起去，如果已经攻下镇江，就让夏国相带兵攻常州。让范绍祖带领洞庭湖水师，配合夏国相攻打长江里的清廷水师。杨明遇带兵攻打苏州。”
林壮忙道：“殿下放心，我亲自去一趟，毕竟关系到军情里的几个变化。如果只是让手下的人去，到时候一点拿不了主意，可要误了大事。”朱由栋道：“也好，如果水师没到的情况，让杨明遇先不要攻打崇明岛。毕竟没有水师的配合，我们对于水战，都是门外汉，这些事情让水师的范绍祖去做。”
林壮道：“殿下放心，我一定将殿下的话给带到，不让其他人随便指挥。”随后蒋超和马惟兴也都去集合军队，准备出发，攻取南京的其他州府。
几人刚出去，彭昌宝就进来道：“殿下，衙门外来了一些人，说是要求见殿下。”朱由栋随口问道：“都是些什么人？”彭昌宝道：“来的人不少，有些人看起来就是些平常百姓，还要一些南京城里的商号管事和本地的士绅。”
朱由栋皱眉道：“我并没有召见这些人啊？怎么突然有这些人来求见呢？”彭昌宝道：“具体情况我就不知道了，只是听说有一些人是咱们大明的国公侯爷。”
朱由栋愕然道：“我大明什么时候在南京城有这些勋贵了？之前可没听说还有大明的人在南京啊。”一旁的周昌顿时脸色有些怪异道：“殿下，咱们大明在南京里，确实有些勋贵，只是...。”
朱由栋道：“只是什么？你说清楚些。”站在门口的马腾升道：“殿下，这些勋贵都是投降过清廷的人。”朱由栋道：“投降过清廷的人？这到没什么好奇怪的，我们复明军之中，投降满清又反正的人多了去，只要他能真心反正归明，到也没什么。”
见朱由栋依然没有明白，周昌道：“殿下，他们就是弘光的时候，在南京城投降的那些国公侯爷。他们也没有抗清，反而是率先带头投降了满清。这次估计是看我大明光复了南京，想找殿下恢复他们的爵位。”
朱由栋这才明白过来，来求见自己的这些人，都是当年南京城的那些勋贵。想起这些蛀虫，顿时就有些头疼。但这些勋贵要怎么处理，必将影响自己后面处理宗室的事情，朱由栋不由的有些犹豫起来。
见朱由栋为难，周昌道：“要不这样，殿下先以军务繁忙为由，打发他们回去？等朝廷有了主意后，再接见他们不迟。”
朱由栋道：“算了，这些事情拖的越久，恐怕越麻烦。彭昌宝，你先带他们在签押房等着，我等下再见他们。”彭昌宝立即出去安排，马腾升又道：“殿下，哪些商号的人怎么办？”
朱由栋对周昌道：“商号的事情，我就不出面了。周昌，你和马腾升一起去看看。怎么处理你自己拿主意，然后报给我就可以了。”周昌和马腾升立即出去接见哪些商号的人。
等这些人都离开后，朱由栋对林壮的副手沈士杰道：“现在其他的军队，情况怎么样？”沈士杰立即道：“汉中方面，虽然党守素将军也尽力防守，但凤县依然没有守住。后来有了殿下的命令，党守素将军自己亲自上阵，拼死守住马岭关。加上陕西清军的粮道拉长，才没让攻打汉中的清军得逞。”
朱由栋听见汉中能够守住，也是很欣慰，道：“党守素虽然有时候不想出力，有些想要保存实力。但在关键时刻，还是能当大任的。”沈士杰道：“党守素将军虽然守住了马岭关，但自己军队也损失惨重。”
沈士杰看了一下朱由栋接着道：“保宁总兵牛秋实的六千军队，见党守素防守吃力。便直接将略阳、两当等地的百姓，全部迁进汉中，然后留少量的兵丁防守虞关。全军退至阳平关，然后将大军调往马岭关去了，也暂时解了党守素将军的燃眉之急。”
朱由栋一听，然后又在舆图上找了一下，顿时眼前一亮。道：“牛秋实这招好啊，空出的山谷，少说也有两三百里路程。如此坚壁清野之下，清军就是想要去偷袭，也没有粮草可征。不错，不错。”
沈士杰道：“殿下，确实是这样，清军也派斥候去探查。知道这样的情况后，也就没有走阳平关一线进军了。然后又有了祁三升帮党守素守住后路，根本就不惧清军偷袭，所以党守素终于将清军，挡在了马岭关前。现在清军攻打已经快一个月了，估计也要粮草不济，该是时候退军回凤翔府了。”
朱由栋点了点头道：“想来也差不多了，陕西清军的军粮也不会太多。当初要供养吴三桂的军队，大量的军粮已经运进汉中了。现在丢了汉中，恐怕也经不起如此的消耗。而且还有蒙古八旗去西安搜刮一番，现在傅喀禅又带着军队走商洛一带，这些八旗兵，估计带队军粮不少。如此算下来，陕西清军离退兵也不远了。”
沈士杰道：“傅喀禅带着八旗军在商洛一带，根本就没有起到什么作用。满洲八旗大多数都是骑兵，在商洛的山区带，根本就发挥不了优势。被祁三升带着苗人翻山越岭，在山里打的不敢出头。就在这个月十五的时候，八旗兵受不了，已经退回西安去了。”
朱由栋有些意外道：“哦，没看出来祁三升还有如此本事啊。如此说来汉中已经无忧了。”沈士杰道：“殿下说的对，如今反而是晋王那边，先前防守蒙古八旗，现在又有河南巡抚带着五万大军，与晋王对峙。”
朱由栋道：“那襄阳一带呢？”沈士杰道：“现在襄阳的情况很平静，清兵根本就没有兵力来攻。”朱由栋看了一下舆图道：“估计也是由于襄阳易守难攻，现在清廷根本就没有那么多的兵力来攻打，所以暂时没有人来攻打。”
朱由栋想了一下，道：“宋高举他们到哪里了？”沈士杰上前在舆图上指着道：“宋高举将军攻下常德，岳州后，本来是想去武昌的。但是现在湖南那边战事吃紧，便带着一万降军和本部，南下长沙了。”
朱由栋愣了一下，道：“湖南的战事吃紧？怎么会这样呢？”沈士杰道：“湖南地方上，并不知道武昌已经被我们攻下。在长沙的是杰书，他是怕顺治治罪，提前跑去长沙的，现在又了战事，也不该再跑了。所以一直亲历前线督战，湖南的清军，见杰书亲自督战，所有的军队都爆发出了惊人的战力。”
听了沈士杰的话，朱由栋道：“就算如此，长沙也没多少军队啊，怎么临国公和荆国公两只军队，也不可能打不下长沙。”沈士杰道：“长沙本来军队不多，但是杰书去了后，直接让长沙巡抚卢森开了府库。直接把银子搬到城墙上，然后发动搬迁的民壮守城。”
朱由栋道：“他们居然直接开了府库？”沈士杰道：“是的，而且还有驻守在长沙的汉正黄旗的旗主祖泽润，在长沙有两千多汉军旗士兵。之前，被调回长沙的正红旗梅勒额真吴国炳，手里也有一千士兵。”
沈士杰看了朱由栋一眼道：“这样一来，长沙的守军，就足足有三万之多。临国公他们只有两万多人，还要防备广西的清军。一时间也就攻不下长沙了。”